在空间任务中，在为航天飞机提供动力以及饮用水方面，质子交换膜燃料电池（PEMFC）已被广泛应用；在民用燃料电池中，作为中型电源应用并进入了商业化阶段的磷酸燃料电池（PAFC）成为首选；在工业试验阶段，熔融碳酸盐型燃料电池（MCFC）取得了不错的成绩；起步较晚的固态氧化物燃料电池（SOFC）则是发电领域最有应用前景的燃料电池，是未来大规模清洁发电站的首选。
一直以来，人们都在寻找一些既能够高效利用又不污染环境的能源利用方式。燃料电池可以说是较为理想的技术，它发电效率高、环境污染少，有利于推动电池技术的发展。但是，燃料电池在某些方面依然存在短板，需要进一步的探索。
燃料电池拥有诸多优势，但存在短板仍需探索
现在，生活中最常见的是锂电池。与燃料电池相比，二者有相同亦有不同。
放电原理相同。燃料电池和锂电池在对外输出电能时不是热机过程，而是等温绝热的电化学电源过程，因此效率都比较高。
工作方式不同。燃料电池输入的是化学能，输出的是电能。锂电池则是输入电能，输出的也是电能。因此，燃料电池是能量转化装置，而锂电池是储能装置。
相比之下，燃料电池的优势很多。
从能源结构的角度看，燃料电池占上风。在化石能占绝大部分的背景下，如何提高从化石能到消费终端的效率是电池领域考虑的重点，这其中的关键就在于能量转化装置的变革。相比之下，储能装置更侧重于优化能量利用的效率。
燃料电池对环境的污染也比较小，比如前面提到的以尿液为动力的燃料电池。其研究人员表示，这种电池是一种“价格低廉，可再生，可保持碳平衡”的产品。它的浪费程度极低，生产成本低至2英镑（约合18.5元人民币）左右。
从运载工具的角度看，燃料电池比锂电池更加适合汽车业态。化学反应需要氧化剂、燃料和反应场所，锂电池汽车需要这三样齐全，而燃料电池只需要后两样。锂电池中的氧化剂、还原剂存放的距离极近，即使不在工作状态下也会自己放电。而且锂电池为了达成寿命循环往往浅充浅放，因此不能保证每个循环都将油用干或加满，这就导致真实的里程比理论上的还要减半。
此外，燃料加注的过程是物理过程，速度上不受限制。而锂电池汽车能量的恢复是充电过程，也就是电解反应，这种过程需要控制，并且加注速度也受到电池技术进展程度的制约。
由此可见，燃料电池的优势的确不在少数。不过，燃料电池在一些方面仍存在缺陷。
比如在便携式电子设备的应用上，由于燃料电池的反映特性，系统集成简化难度远高于已经充分集成的锂电池及其他种类的电池。
另外，燃料电池的产业化程度偏低。目前的燃料电池尚未形成产业链，相比之下，锂电池针对便携式电子设备的现场电源已经形成了批量制造业。
不过，在汽车方面，燃料电池和锂电池均未形成产品制造业，其中最大的难点就在于电化学反应如何适应电机的负载大动态需求。
综上所述，燃料电池用途广泛，又拥有诸多优势，但是在许多方面仍存在短板，尚不能大规模投入使用。不过，科学家们和研究人员并未停止努力。巴斯大学的研究人员们一直在对尿液燃料电池进行研究，参与了这一项目的斯库勒博士表示：“这种新技术能改变穷人的生活，他们无需花大价钱就能用上电，这让我感到成就感十足”。希望在未来的某一天，燃料电池能够真正进入到我们的生活中，实现真正的高效率无污染发电。
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